雨之国，都城。
自来也进入雨之国后便先行前往雨隐村附近寻找自己的三个徒弟，凭借着自身仙人模式的感知力和忍界三忍的名头短短几天他就在几名正在巡逻的晓组织成员帮助下来到了晓的临时基地。
师徒四人久别重逢，一肚子的话来不及倾诉自来也就注意到了长门双眼的问题。
一番了解后知道长门的双眼被斑挖走，好在斑当初没有立刻杀他，而且由于斑和长门的战斗动静太大引来了半藏和自来也，这才在两人的掩护下让弥彦和小南有机会将他带走。
半藏的实力和雄心早已不如当初，但没有和团藏合作的他选择了扶持新生力量，在最后关头将雨隐村托付给了晓组织，弥彦也因此成为了新任的雨影，三人带着一众雨隐村的暗部被白绝追杀一路逃回村子。
弥彦还未来得及接任雨隐，斑就解决了半藏杀上门来，弥彦自知他们不是斑的对手只得带上村民逃离，不过他刚刚成为雨隐，公信力不足，并不是所有人都愿意随他离开家园，所以留下的那些人都随着村子一起沉寂在了这片废墟中。
自来也闻言不禁感叹，“想不到当初被称为半神的半藏都死了。”
自来也说着注意到了自己弟子的情绪不高便又补充道：“不过，对于忍者而言怎样活着无所谓，怎样死去才是最重要的。”
半藏为了雨隐村的未来选择了牺牲自己，自来也陷入沉默，曾经授予自己三忍称号的人也无愧于他的称号。
“他是一名伟大的忍者。”
“自来也老师...”
小南流着泪水抱住他，她现在感到痛苦无比，短短几日他们经历的太多太多，晓的成员几乎损失了七成，太多太多的朋友死在她的面前，就连长门也险些死去。
“没事的，没事的，老师回来了，会保护好你们的，毕竟，我可是蛤蟆仙人啊！”
自来也的到来让这个基地久违的出现了笑容，他带来了忍界联军的消息和一些资源，甚至拿出了从高明那里购买的大瓶药水让小南喂给了重伤的长门，并亲眼看到他长出新的眼睛。
几人不敢置信的看着长门新生的双眼，小南拿药的手都在颤抖，激动的抱住了长门，几人见状纷纷泪如雨下。
自来也站在一旁面带微笑静静的看着这一切，不得不说，晓确实是他看到的氛围最好的组织。
小南拿着自来也的药兴奋的给那些重伤垂死的晓成员喂下，待反应到这是自来也的东西时药水已经见底。
能有此奇效的药水怎么会便宜呢？
小南意识到这一点，羞愧的站在自来也身前道歉。
自来也只是一笑，轻轻拍了拍小南的脑袋没有丝毫在意。