万华仙宗宗门所在的龙华山位于玄鹤洲南部偏东方向，在天一宗东北方近两千八百余里处。其山势算不得高大，只因山峰连绵有如龙形，又因其上多产华烨石，从而得名龙华山。
其实，万华仙宗前身乃是称作“万华宗”。九千余年前，其创派祖师万华道人云游四方时，发现了此地蕴藏丰厚的华烨石矿脉，遂在此开宗立派，建立万华宗。
而华烨石乃是炼制筑基到元婴修士所用的低阶法宝与飞剑的必需材料之一，故而万华宗立派之初靠着这一项灵材资源的收入在玄鹤洲还算颇为富裕，也闯出了一些名堂，宗门规模也随之逐年扩大。
而又在五千余年前，其祖师万华道人经历万难终于修至劫仙，并不久渡劫成功，飞升仙界而去。当时的掌门乃是他的关门弟子，为感念师尊，赞颂其飞升成仙的伟绩，遂将宗门改称万华仙宗，并建造万华仙殿，塑立万华道人仙师像，以香火供奉祭祀。
因这万华道人成仙飞升之事，前来万华仙殿内敬香祈福者一度络绎不绝，因时有灵验，数百年间香火不断。而万华仙宗则借此机会广招弟子门人，一跃成为玄鹤洲及周边五洲的第一大宗门，一时风头无两，弟子出行时也是被前拥后簇，颇受追捧，风光无限。
但好景不长，先是在四千余年前，华烨石矿脉被采掘将尽，时任掌门不得不下令封矿，不再对外出售华烨石，只在宗内有需要时才开启矿洞采掘一些。此时，万华仙宗因失去财物来源，已隐现颓势。
其后，在两千多年前，又不知其门人怎么就招惹到了一个魔道散修老怪，被其偷入宗门报复，一把魔火烧了宗门存放玄黄两阶典籍的传承殿，众多经数千年岁月积累下来的功法秘籍、炼器秘法、丹方、阵图等全部毁于一旦。这老怪修为高深，门内长老联手也不能阻挡，在心狠手辣地屠戮数百弟子，又杀死了几个宗门核心长老毁掉其所保存高阶功法后，方才扬长而去。这场可谓万华仙宗创派数千年来最大的一场浩劫，直接导致了几千年从未中断的传承损失大半，只有侥幸存活的一些弟子与长老所修功法得以保存下来。
曾经强盛显赫的万华仙宗自此更是一落千丈，剩余弟子门人又四散离去多半，山门因此凋敝清冷，令当时的玄鹤洲及其附近几洲修士每每谈及此宗门俱都唏嘘不已。
关于此宗衰落原因的传言也流传无数，有传言说这是因万华道人飞升耗尽了此宗气运才该有衰落之劫；也有传言说是万华道人飞升后得罪了仙界某大能，其一怒之下，降下天罚毁其根基，那散修老怪只是代天行事；还有说是那魔道散修老怪本是万华道人还在下界时的仇人，其因不敌万华道人一直躲藏不出，直待自己将要飞升魔界才前来毁其宗门进行报复……总之万华仙宗衰落之事，众说纷纭，但都不约而同地往万华道人这位神秘的飞升祖师身上靠拢。
这之后的一千余年间，万华仙宗靠着少数还在坚守的忠贞弟子与长老苟延残喘，延续着剩余传承，再不复昔日之威风。