朝堂上的文武百官奉命去观看文震孟行刑，魏忠贤戴了八梁冠，穿着绣蟒的朝服，端坐着中间，他身后左边站着内监，右边站着锦衣卫，前面还有手持木棍的旗校。
魏忠贤手里端着茶杯，用一种玩味的眼光看着文震孟，仿佛在说：“你别看自己是状元郎，就自以为了不起，也不看看现在的朝堂是由谁来拿控，敢跟我作对，一样打得你半死不活。”
文震孟虽然已是浑身大绑，但是一向刚直的他，仍然挣扎着挺起胸膛，傲然面对魏忠贤。
时辰已到，魏忠贤接过小内监递过来的圣旨，宣读道：“奉天承运，皇帝诏曰：文震孟枉顾皇恩，不思效忠朝廷，妄议朝政“，魏忠贤宣完圣旨，挥了挥手，招来一个小内监，小声地在他耳边说了几句，才喝道：”行刑！“
文震孟不屈地喊道：“我是冤枉的，我要见皇上！”在一边观看的黄道周此时再也按耐不往，就要出去与魏忠贤对峙，卢象升眼含热泪连忙把他拉往：“幼升兄，魏阉这是奉了皇上的圣旨，你要当场抗旨么！”
虽然卢象升对魏忠贤如此陷害忠良，也是恨之如骨，可是他知道大明王朝开国三百年以来，每一位皇帝为了加强皇权，都要借用锦衣卫和东厂来与朝臣相对抗；正德元年（公元一千五百零六年），刘瑾专权，给事中戴铣为首的二十多名言官，上奏弹劾刘瑾，刘瑾使用了卑鄙手段，请到武宗皇帝的圣旨将他们全部实施了廷杖；正德十四年，群臣后来为了劝阻武宗皇帝不要南巡，引发武宗皇帝廷杖舒芬为首的一百四十六人，打死了十一人；本以后武宗皇帝已是极致了，然而随后的嘉靖皇帝更是“登峰至极”，因为嘉靖皇帝要追认自己的父亲为皇帝，而与朝臣们反目，当场打死了十六人。
就在卢象升、黄道周说话的时侯，校尉们上前将文震孟脸朝下摁倒在指定的位置，为防文震孟咬舌自尽，几个校尉们强行将他的嘴巴扳开，放进了一个细小的圆木棍，又把文震孟头部带上一个布套，文震孟顿时感觉像盲人一般暗无天日，虽然看不到，但文震孟能感觉到几只大手粗暴的将自己上衣揪起，裤子拉扯下来，下身顿时一时冰凉。
一向自尊心极强的文震孟当着这么多人露出自己最为的部位，一时之间不禁羞愤交加，如果不是口里含着枚，他自想咬舌自尽，“一了百了”。
监刑太监高呼道：“搁棍！”两旁站立的旗校也高声附和，此时，旗校中有一个长相粗豪的人，拿着头号大仗出列，把杖搁在文震孟的臀部之上。旗校们齐声喊道“打”！行刑的旗校大声呼应，他满脸横肉，高高举起头号大仗，看上去确是威势惊人，呼的一声，大仗带着一片风声抽打到了文震孟的臀部。
“啪”的一声，这一仗抽到屁股上，文震孟直觉得屁股像着了火一般痛，情不自禁的发出一声惨叫，屁股马上青紫了一大块。“啪”、“啪”、“啪”一下又一下，打得文震孟皮开肉绽，他咬紧了牙关，决定再痛也不再叫喊，慢慢地他晕迷了过去，文震孟脑海中时空一阵变幻，仿佛回到了小时侯刚刚上学的时侯，眼前浮现出父亲的脸，他淳淳教导道：”你想当大臣，皇帝可能会当众打你的屁股，你准备好了么？“