会是岁冬，奉圣夫人客氏本已出宫后复入，周宗建首抗疏极谏，直言曰”天子成言，有同儿戏。法宫禁地，仅类民家。圣朝举动有乖，内外防闲尽废。此辈一叨隆恩，便思逾分，狎溺无纪，渐成骄恣，衅孽日萌，后患难杜。王圣、硃娥、陆令萱之覆辙，可为殷鉴。“天启皇帝以旨诘责周宗建，然而，清议由此重之。
胡子睿知道王圣本是东汉汉安帝的乳母，虽有推燥居湿之勤，然汉安帝前后赏惠，过报劳苦，而王圣无厌之心，不知纪极，外交属托，扰乱天下，损辱汉朝，尘点日月；陆令萱是南北朝时北齐人，她本是后主高纬的乳母，然而她趁着后主昏庸之际，把持朝政，扰乱宫廷，最后导致北齐亡于北周，陆令萱自尽，其家族成员也被株灭殆尽。
次年，广宁失。廷臣多庇王化贞，欲甚熊廷弼罪。周宗建不平，为剖两人罪案，颇右熊廷弼，诸庇化贞者乃深疾周宗建。
京师久旱，五月雨雹。周宗建谓阴盛阳衰之征，历陈四事一专讥大学士沈纮；一请宽建言废黜诸臣；一言熊廷弼已有定案，不当因此罗织朝士，阴刺兵部尚书张鹤鸣、给事中郭巩；一则专攻魏进忠，略言”近日政事，外廷啧啧，咸谓奥窔之中，莫可测识，谕旨之下，有物凭焉。如魏进忠者，目不识一丁，而陛下假之嚬笑，日与相亲。一切用人行政，堕于其说，东西易向而不知，邪正颠倒而不觉。况内廷之借端，与外廷之投合，互相扶同。离间之渐将起于蝇营，谗构之衅必生于长舌。其为隐祸，可胜言哉！“
魏进忠者，魏忠贤故名也。时方结客氏为对食，廷臣多阴附之，其势渐炽，见周宗建疏，衔次骨，未发也。邹元标建首善书院，周宗建实司其事。邹元标被罢免，周宗建乞与俱罢，先帝不从。巡视光禄，与给事中罗尚忠力剔奸弊，节省为多。寻请核上供器物，魏忠贤怒，取旨诘责。周宗建等再疏力持，魏忠贤滋不悦。
给事中郭巩者，先以劾熊廷弼被谪。熊廷弼败，复官，遂深结魏进忠。知魏进忠最恶周宗建，乃疏诋熊廷弼，因诋朝廷之荐熊廷弼者，而周宗建与焉。其锋锐甚，南京御史涂世业和之，诋周宗建误熊廷弼，且误封疆。周宗建愤，疏驳涂世业，语侵郭巩，抉其结纳忠贤事。郭巩亦愤，上疏数千言，诋周宗建益力，并及刘一燝、邹元标、周嘉谟、杨涟、周朝瑞、毛士龙、方震孺、江秉谦、熊德阳辈数十人，悉指为熊廷弼逆党。
周宗建益愤，抗疏力驳其谬，且曰“李维翰、杨镐、袁应泰、王化贞，皆坏封疆之人也；亓诗教力主催战，赵兴邦贿卖边臣，皆误封疆之人也；其他荐维李维翰、荐杨镐、荐袁应泰、王化贞者，亦误封疆之人也。郭巩胡不一击之，而独苛求熊廷弼，且诋荐熊廷弼者为逆党哉？”
当是时，魏忠贤势益盛。周宗建虑内外合谋，其祸将大，三年二月遂抗疏直攻魏忠贤，略言“臣于去岁指名劾奏，魏进忠无一日忘臣。于是乘私人郭巩入都，嗾以倾臣，并倾诸异己者。郭巩乃创为‘新幽大幽’之说，把持察典，编廷臣数十人姓名为一册，思一网中之。又为匿名书，罗织五十余人，投之道左，给事中则刘弘化为首，次及周朝瑞、熊德阳辈若而人，御史则方震孺为首，次及江秉谦辈若而人，而臣亦其中一人也。既欲罗诸臣，以快报复之私，更欲独中臣，以释魏进忠之恨。是察典不出于朝廷，乃郭巩及魏进忠之察典也。幸直道在人，郭巩说不行，始别借熊廷弼，欲一阱陷之。