祭孝陵这样的大事，本来应该是太常寺的事。但朱亨嘉为了精简机构、减少开支，在颁布《明定国是诏》后，已经将太常寺并入了礼部，正三品的太常寺卿成了提拔官员的虚职，祭祀的事由正五品的祠祭司郎中负责。
按惯例，孝陵主持祭祀者为世袭魏国公。可第十一代魏国公徐文爵没有气节，降了清。这种人怎么有资格主持呢？否了。
所以，朱亨嘉金口一开，将主持祭孝陵一事，交给了礼部尚书孙金鼎。
孙金鼎很得意，身为次辅，平时排位总在关守箴后面，这次总算可以名正言顺地压关守箴一头。
祭孝陵，国之大事，须得提前十天准备。七月二十一日朱亨嘉谕令孙金鼎做准备，八月一日才准备妥当。
其中艰辛历程如下：
七月二十一日，祠祭司请旨遣官行礼。朱亨嘉大笔一挥：准。于是，礼部便忙着安排祭祀各个环节的官员。人数不多，经过精简，精简，再精简，也就派了两百多个官员而已。
七月二十六日，祠祭司委派协律郎提调一百二十八名乐舞生于南京奉天殿，演习陵坟祭祀礼仪。大明朝祭陵不奏乐，乐舞生在陵寝祭祀活动中，事实上只是充当执事、赞礼等角色。
急切间，找不着这么多乐舞生，只能从官员中选拔。朱亨嘉要求不高，年轻、英俊、懂礼仪便可。文官中找遍了，没那么多帅小伙，只好又从武将中挑选了一批，才补齐。
七月二十八日，祠祭司委牲所千户一员，领旗军九名，将陵祭所用香、祝、牲、帛等物送至江宁县。江宁县官吏早已在县衙西侧建好了香帛亭，以鼓乐迎于县南门外，行一拜三叩头礼，然后奉于香帛亭内。
七月二十九日，祠祭司官员将香、祝、牲、帛等祭祀用物送至孝陵。江宁县官吏在县城西门外恭送，行礼如迎时。
然后，由供祀厨役将应制祭品制做出来。宰杀三牲的地方是孝陵文武方门（正门）西边的宰牲亭，加工祭品的地方在神厨，临时储放祭品的地方在神库。
光一个宰杀三牲，就得安排好多官。有的负责开牺牲所中门；有的负责鼓乐旗帜；有的负责宰割礼仪；有的负责三牲摆放??
七月三十日，开始陈设祭案、祭品。祭案分为正案、从案两种。其中正案为帝、后祭案，从案为皇妃祭案。
太祖高皇帝和马皇后各设一案。案上放着各色各样的祭品，马皇后正案上陈设的祭品除了不置酒壶置茶壶外，其余同高皇帝案。正案之前还共设黝牛（牛犊）一、羊一、豕一，再前置帝后奉先制帛各一段，帛前设香一、烛二。左侧设司樽桌放酒樽，右侧设祝桌放祝版。祝版上书写祝文。
祝文，是祭司飨神之辞，亦曰祝辞，十分重要。
孙金鼎觉得自己的文采差了些，他找来了太傅丁魁楚：“丁公，予有一事相求”。